深圳市航运集团有限公司是一家以港口航运业为主的企业集团，前身是1982年成立的深圳市航运总公司，2007年2月经深圳市国有资产管理委员会批准完成产权主体多元化的改制。公司经营范围为内河、沿海、远洋船舶客货运输和仓储、港口装卸，拥有全资企业7家，合资企业6家。

在水上客运方面，公司全资企业深圳市鹏星船务有限公司是珠江三角洲开通客运航线最早的公司之一，拥有高速客船10艘。主要经营蛇口至珠海、澳门、香港新机场等航线。

在水上货运方面，公司全资企业深圳市深粤航运公司拥有千吨级集装箱船3艘，在珠江三角洲至港澳之间从事集装箱支线运输业务。公司全资企业鹏海航运有限公司及合营企业亚森航运有限公司拥有4艘1.8万吨级木材散货轮，目前的主要业务为巴布亚新几内亚、东南亚至中国的木材近洋运输以及其他散杂货物运输。公司已参股总投资6亿美元的广东液化天然气（LNG）运输项目，公司占股比例10.5％。

在港口业务方面，公司全资企业深圳市航总上步港务公司和控股企业深圳圳华港湾企业有限公司主要从事建材杂货装卸、仓储服务。公司还积极推进深圳港东宝河港区码头工程项目，该项目已作为深圳市2007年重大前期项目。

深圳市航运集团有限公司在未来的发展中，将完善企业内部机制，提高企业竞争能力，在市场经济大潮中不断发展壮大。